На северо-восточном берегу залива – губы Онежского озера в Заонежье расположено старинное село Великая Губа, впервые упомянутое в исторических хрониках в 1583 году. Стояла когда-то здесь церковь Пророка Ильи, построенная в 1647 – 1654 годах. Но в 1867 году на месте ветхого деревянного храма поселяне построили новый – каменный, который был освящен во имя византийского святого – преподобного Алексия, человека Божия.
Эта каменная церковь строилась на средства старшего священника и пожертвования прихожан и была освящена в январе 1867 года. Здание выполнено в провинциальном варианте «русского стиля» 1860-1870 гг.
Бури времен государственного атеизма изувечили красивое церковное здание. Была разобрана колокольня, что нарушило целостный архитектурный ансамбль, которым проезжавшие мимо паломники на Соловки любовались издалека, в Онежском озере. Алексиевская церковь уцелела только благодаря тому, что в безбожные годы в ее здании расположили очаг культуры – библиотеку, а не, как обычно, овощехранилище.
К середине 1930-х годов, судя по панорамному снимку села Великая Губа, церковь еще сохраняла пятиглавое венчание кафоликона и надстроенную над папертью восьмигранную шатровую колокольню.
Затем, в связи с упразднением церкви и переделкой ее под клуб, венчающие главы и колокольня были снесены, заделан западный вход и пробит новый с южной стороны.
Постепенно, после строительства ряда новых, более высоких, объектов в селе, бывший храм из архитектурной доминанты, которой он являлся первоначально для всех пяти деревень Великогубского куста, превратился в локальный композиционный акцент, воспринимаемый только на ограниченной территории. В 1950-х годах в селе был построен новый деревянный клуб, после чего церковь еще некоторое время использовалась в качестве совхозного склада, но уже в 1980-х годах была заброшена и постепенно ветшала.
В начале 1990-х годов по заявке Великогубского сельского совета был начат ремонт храма. Однако из-за недостатка средств он ограничился только установкой строительных лесов и ремонтом металлической кровли. В 1994 году Постановлением Совета Министров Республики Карелия церковь в Великой Губе была безвозмездно передана в собственность Петрозаводской и Карельской епархии.
В конце 90-х годов старинную церковь во имя Алексия, человека Божьего сельчане по мере своих сил стали постепенно восстанавливать, начав с создания в Великой Губе православной общины прихода Ильинской церкви – в память о самом древнем храме родного села. И как-то сразу же в одном из домов поселения была обнаружена храмовая икона св. Алексия, человека Божия – великая ценность, воспринятая сельчанами как призыв из глубины веков к духовному возрождению. Правда, хозяйка иконы, пожилая женщина, с бесценной святыней храма без вознаграждения расстаться не пожелала, сетуя на тяжесть своего материального положения. Уважение к памяти предков, строивших когда-то и благоукрашавших храм, бескорыстие расцерковленным поколениям сельчан местной библиотеке привить так и не удалось, несмотря на книжные знания, которые в церковных стенах она усердно несла в массы.
Надо сказать, годами ждали и надеялись великогубцы, что в их селе снова появится православный священник. В ноябре 2009 года благочинный Заонежского округа Петрозаводской и Карельской епархии, настоятель Екатерининского храма г. Петрозаводска протоиерей Андрей Верещагин совершил в восстанавливающемся Алексиевском храме первую, после его закрытия, Божественную литургию. И вскоре Архиепископ Мануил назначил настоятелем восстанавливающегося храма в Великой Губе священника Владимира Шурупова, приехавшего в заонежское село из города Костомукша. Для семьи священника, у которого трое малолетних детей, сельчане выделили добротный крестьянский дом и радостно встретили батюшку, осознавая, что их преданность старинному храму была вознаграждена.
В октябре 2012 года Указом Епископа Петрозаводского и Карельского здание церкви было передано в собственность местной религиозной организации православного Прихода храма преподобного Алексия, Человека Божьего. Начался ремонт церкви.
Теперь предстоит приложить немало усилий, чтобы белокаменный Алексиевский храм полностью был восстановлен в своей былой красе. Будет окормлять священник и другие старинные храмы и часовни Заонежья, восстанавливаемые местными жителями, в которых когда-то молились их предки, тонко ценившие красоту родного края, воплощенную ими в деревянном церковном зодчестве.
В течение последних лет силами прихода на памятнике было заменено кровельное покрытие, стропила и обрешетка, восстановлена центральная главка над кафоликоном, заделан вход с южного фасада и восстановлен исторический дверной проем центрального входа в храм с западного фасада, произведена полная замена электропроводки, внутри здания обустроены теплые полы на водном теплоносителе, в отдельном помещении внутри храма смонтирована котельная. Общее состояние объекта культурного наследия в настоящее время специалистами оценивается как удовлетворительное. Ремонтно-восстановительные работы на памятнике продолжатся.
Настоятель - иерей Владимир Шурупов.
Богослужения совершаются еженедельно.